热带作物基因组智能育种平台 Tropical Breeding Genome Hub
围绕国家种业振兴战略，构建覆盖木薯、甘蔗、睡莲等热带作物的 "基因组解析 — 基因挖掘 — 分子育种" 全链条支撑体系
原创性科学贡献
聚焦被子植物演化、热带作物驯化与适应性、AI驱动的基因挖掘三大方向，形成系统性原创成果。
重塑被子植物演化认知
明确了开花植物起源于石炭纪；
古多倍化产生了被子植物，促进其发育和抗逆网络的重构；
破译了系列睡莲基因组，提出了被子植物早期花发育模型、花香起源、被子植物特有的Pectin lyase。
🌱 应用：睡莲属及早期被子植物分子育种的"参考基因组标准"植物抗逆和开花
Plant, Cell & Environment, 2020 · 被引 150 次
首次系统揭示被子植物多倍化事件与逆境适应的协同演化关系。
🌱 应用：直接支撑木薯抗旱品种选育，服务粮食安全AI驱动的育种和合成生物学
首个基因组选择育种的一站式精准预测软件，AI赋能提升预测准确率
🌱 应用：已在木薯、猪、马铃薯、小麦等作物验证，性能远超同类软件。成果应用
成果已深度嵌入国家南繁育种、热带农业产业升级和全国科研协作网络。
木薯基因组资源支撑南繁育种
已应用多组学数据库支撑全国育种研究
开放共享睡莲基因组学驱动热带花卉产业升级
产业应用支撑马铃薯遗传育种研究
产业应用核心技术创新
原创工具与方法，解决热带作物育种中的关键技术瓶颈。
SCCGs · 含硫化合物基因预测
首个基于机器学习的含硫化合物基因精准预测模型，高效挖掘植物含硫化合物相关基因，助力高价值育种基因利用。
FTGD · 花期基因 AI 预测
首个基于机器学习的花期基因精准预测模型，解决传统方法依赖实验验证、效率低下的瓶颈。
CentlER · 着丝粒精准识别
首个植物着丝粒重复序列精准识别算法，突破着丝粒注释的技术壁垒。
HBcloud · 零代码多组学分析
整合多组学数据的零代码分析平台，解决育种家"有数据不会分析"的痛点。
PhyloForge · 综合进化信号算法
整合宏观与微观进化信号的系统发育算法，解决信号冲突问题。
iGS 基因组预测
首个AI赋能的基因组选择育种的一站式精准预测软件
平台数据资源
整合五大多组学层次，为育种提供系统性数据基础设施。
基因组
174+ 种园艺植物，含木薯、甘蔗、睡莲等 T2T 级别参考基因组
转录组
174+ RNA-seq 样本，覆盖多组织、发育阶段及非生物胁迫
变异组
573+ 木薯、98+ 油棕群体 SNP/Indel 变异数据
代谢组
数百种注释化合物，与品质、抗逆等农艺性状关联
表型组
产量、抗逆、品质等多维度表型数据，支撑多组学关联
知识库
以睡莲、土豆、甘蔗相关论文为基础的知识库
社会影响与开放共享
成果已产生广泛的行业影响力和社会效益。
服务国家战略
直接支撑国家南繁种业振兴和海南全球热带农业中心建设
战略贡献覆盖全国 28 省
数据库与工具已服务全国 28 个省级行政区科研与育种单位
开放共享媒体关注
成果被新华社、科技日报、海南日报等主流媒体报道
社会影响